Liiton organisaatioon kuuluvat liittokokous, liittohallitus sekä aluekokous ja aluehallitus.
Organisaatiotasojen toimivalta on kuvattu tarkemmin Koripalloliiton toimintasäännöissä.
Liittokokous hyväksyy Koripalloliiton vuosittaisen toimintasuunnitelman ja vuosikertomuksen.
